A. 開放閱讀框的英文原文
An open reading frame (ORF) is a portion of a gene』s sequence that contains a sequence of bases, uninterrupted by stop sequences, that could potentially encode a protein. When a new gene is identified and its DNA sequence deciphered, it is still unclear what its corresponding protein sequence is. This is because, in the absence of any other knowledge, the DNA sequence can be translated or read in six possible reading frames (three for each strand, corresponding to three different start positions for the first codon). ORF identification involves scanning each of the six reading frames and determining which one(s) contains a stretch of DNA sequence bounded by a start and stop codon, yet containing no start or stop codons within it; a sequence meeting these conditions could correspond to the actual single proct of the gene. The identification of an ORF provides the first evidence that a new sequence of DNA is part or all of a gene encoding for a particular protein.
B. 什麼是開放式閱讀框
open reading frame
就是直接翻譯成蛋白質的那段DNA序列
從atg開始到終止密碼子結束
中間沒有內含子
C. 英語開放性閱讀
1Bus 4
2Bus 1
3 At 8:55
4 One and a half hour
5 At 7:00
D. 什麼是開放式閱讀框
開放閱讀框開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列,不能被終止子打斷。 當一個新基因被識別,其DNA序列被解讀,人們仍舊無法搞清相應的蛋白序列是什麽。這是 因為在沒有其它信息的前提下,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯(每條鏈三種,對應三 種不同的起始密碼子)。ORF識別包括檢測這六個閱讀框架並決定哪一個包含以啟動子和終 止子為界限的DNA序列而其內部不包含啟動子或密碼子,符合這些條件的序列有可能對應一 個真正的單一的基因產物。ORF的識別是證明一個新的DNA序列為特定的蛋白質編碼基因的 部分或全部的先決條件。 An open reading frame (ORF) is a portion of a gene』s sequence that contains a sequence of bases, uninterrupted by stop sequences, that could potentially encode a protein. When a new gene is identified and its DNA sequence deciphered, it is still unclear what its corresponding protein sequence is. This is because, in the absence of any other knowledge, the DNA sequence can be translated or read in six possible reading frames (three for each strand, corresponding to three different start positions for the first codon). ORF identification involves scanning each of the six reading frames and determining which one(s) contains a stretch of DNA sequence bounded by a start and stop codon, yet containing no start or stop codons within it; a sequence meeting these conditions could correspond to the actual single proct of the gene. The identification of an ORF provides the first evidence that a new sequence of DNA is part or all of a gene encoding for a particular protein. 在構成基因的核苷酸序列中存在著一些最終翻譯成蛋白的鹼基段,每三個連續 鹼基(即三聯「 密碼子」) 編碼相應的氨基酸。其中有一個起始「密碼子」--AUG/ATG和 三個終止「 密碼子」,終止「 密碼子」提供 終止信號。當細胞機器沿著核酸合成蛋白鏈 並使其不斷延伸的過程中遇到終密碼子時,蛋白的延伸反應終止,一個成熟(或提前終止 的突變)蛋白產生。因此開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的 鹼基 序列。由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的 終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。 現在有很多找ORF的軟體,包括在線的,如: ORF Finding的功能 ORF Finding 被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。它較早應於序列設計 ,應用優於長片斷、高質量的匹配。進而,它提供了比用標准基因編碼查詢更有用的信息 。ORF Finding 把提交序列分成六個亞區,並對這六個閱讀框分別進行默認,賦予每個亞 區一個確定其編碼內容的度量, 如果可能,將對每一亞區進行進一步分析。每個亞區按照 已有的分類結果,被隨機提交給查找它們是否編碼 蛋白質的特定測試收集器。最後只有那 些具有編碼潛能的重要區域才被報導。ORF Finding 識別是證明一個新的DNA序列編碼特定的蛋白質的部分或全部的先決條件,可用於大規模的開放式閱讀框尋找
E. 什麼是開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)
在構成基因的核苷酸序列中存在著一些最終翻譯成蛋白的鹼基段,每三個連續鹼基(即三聯「 密碼子」) 編碼相應的氨基酸。其中有一個起始「密碼子」--AUG/ATG和三個終止「 密碼子」,終止「 密碼子」提供 終止信號。當細胞機器沿著核酸合成蛋白鏈並使其不斷延伸的過程中遇到終密碼子時,蛋白的延伸反應終止,一個成熟(或提前終止的突變)蛋白產生。因此開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的 鹼基序列。由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。 現在有很多找ORF的軟體,包括在線的,如: ORF Finding的功能 ORF Finding 被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。它較早應於序列設計,應用優於長片斷、高質量的匹配。進而,它提供了比用標准基因編碼查詢更有用的信息。ORF Finding 把提交序列分成六個亞區,並對這六個閱讀框分別進行默認,賦予每個亞區一個確定其編碼內容的度量, 如果可能,將對每一亞區進行進一步分析。每個亞區按照已有的分類結果,被隨機提交給查找它們是否編碼 蛋白質的特定測試收集器。最後只有那些具有編碼潛能的重要區域才被報導。ORF Finding 識別是證明一個新的DNA序列編碼特定的蛋白質的部分或全部的先決條件,可用於大規模的開放式閱讀框尋找。 使用說明測試過程:當一個基因被識別、其DNA序列被解讀時,人們往往仍然無法 弄清相應的蛋白序列是什麼。這是因為在沒有其它信息的前提下,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯 (每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)。 ORF Finding 針對小基因序列,搜索並報導可能的蛋白質編碼區,它檢測這六個閱讀框架,並尋找以啟動子和 終止子為界限的DNA序列,符合這些條件的序列有可能對應一個真正的單一的基因產物。 ORF Finding 通過如下方式處理您的序列: ·定位六個閱讀框上的ORF候選區域 ·對每個候選區域的編碼可能性進行評估 ·如果可能性很高,就把該區域作為可能的蛋白質編碼區進行報導 編碼可能性:是通過從物種訓練模擬器收集來的統計數據確定的用。ORF Finding 進行蛋白質編碼區的預測,有三步程序。 第一步:延伸無終止密碼子的序列,把延伸的片斷定位在六個閱讀框上;它們是下一步進行 開放式閱讀框研究的候選序列。 第二步:用物種hexamer統計表來估算ORF候選區域上蛋白質編碼部分編碼蛋白質的最大可能性。 第三步:根據序列結構和區域最可能成分來計算蛋白質編碼的可能性。 這種測試利用物種的統計學原理把編碼區從非編碼區區分出來,其中包括編碼蛋白質的最大可能性的估算、3 個過程的測試 和 ORF片斷大小的確定。這種測試應用於物種的二次形式,得到一個三個自由度的 chi-square統計量,被稱為候選ORF的二次判別式。這個判別式對於編碼區趨向於取大值,對於非編碼區 趨向於小值,並被固定化,所以非編碼區獲取的值趨向於小於1。 一般通過第一步和第二步,大約61%的非編碼區域產生值小於1的二次判別式。89%的區域的期望值小於2。 經多次應用發現,5.0的結果很理想,它是介於正、誤之間的閾值。 使用方法: 首先選擇你測試的序列的來源(物種),然後直接在輸入 框內填寫您的DNA序列,進行提交即可。但輸入序列的長度不得小於50bp。 結果說明:提供最優的潛在開放閱讀框位置。通常, ORF Finding 會把您提交的序列進行檢測,然後根據閱讀框的次序(+1,+2, +3,-1,-2,-3),給出各閱讀框架的蛋白質編碼區域的 詳細信息。如果同一個閱讀框包含幾個蛋白質編碼區域的話,則這一開放式閱讀框中蛋白質編碼區域 會按照它們的起始核苷酸在該閱讀框上的鹼基位置依次給出。編碼區域的詳細信息包括: ·Numb x: 編碼區編號。從1依次增加,從此您可以知道各編碼區的相對序號和您提交的序列的總編碼區數目。 ·Predicted start、Predicted end: 預測的基因編碼區的開始、結束。是指該閱讀框的該編碼區上編碼蛋白質的核苷酸的起始和結束位置。 ·Reading frame:閱讀框。六種框架(每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)中的哪一種。 ·Type:類型。說明這一蛋白質編碼區是預測出來的還是存在的。 ·ORF start、ORF end:開放式閱讀開始、結束。即這一編碼區的起始和結束。它除包括編碼蛋白質的核酸序列外,還包括調控基因、起始密碼子、終止密碼子等。 ·Spectral:吸收光譜。 該段核苷酸的吸收光譜數。 ·ORF length:ORF長度。 ·Max likelihood:最大可能性。請參考 測試過程 中的 編碼可能性。 MLE length score:最大可能性估量長度評估。即該編碼區上編碼部分佔整個ORF區的比例。 ·Quadratic discriminant:二次判別式的值。對於編碼區趨向於取大值,非編碼區趨向於取小值
F. 什麼是英語里的開放式問題和封閉式問題
開放抄式問題就是可以有很多答襲案且沒有對錯
比如 what do you think the game "Limbo" is talking about?
你覺得「地獄邊境」這款游戲是在講什麼?
封閉式一般回答很少,有時就兩個
比如,Have you had lunch?
你吃午餐了嗎?
G. 如何處理英語閱讀的開放性問題 百度文庫
指的是問答題嗎?對於開放性的題目,需要先充分理解閱讀材料,再結合文章和自己的理解,組織好語言,寫下答案即可
H. 開放式學習的延伸閱讀
2012年8月28日,由江干區青年企業家聯合會主辦的「讓創二代在區域經濟提升發展中成為主力軍·對話名師」主題沙龍在天馬大酒店舉行,清華大學經濟管理學院教授周文擔任主講,來自杭州江干區的30多位青年企業家代表就如何提高學習力、汲取公眾信息為我所用、針對自身行業特點進行產業布局等關注企業提升發展的諸多問題與名師面對面。沙龍由江干區青年企業家聯合會會長、浙江杭寶集團有限公司總經理章國恩主持,杭州江干區工商業聯合會主席、總商會會長李紅應邀出席了本期活動。
近年來,江干區進入城區框架和經濟社會快速轉型的關鍵期,以總部經濟、金融中心、國際商貿等現代服務業為主導替代傳統製造業的經濟發展模式正在形成。想當年,「吃苦不叫苦」的老前輩,刻畫了「四千萬」(千方百計、千辛萬苦、千言萬語、千山萬水)和「兩板」(白天當老闆,晚上睡床板)的生動形象。而今,「80後」、「90後」的新生代所面臨的形勢、條件、環境與父輩們迥然不同。他們或許「不差錢」,艱苦奮斗似乎成了「聽爸爸講那過去的故事」。但是,企業亟待轉型升級,面臨著父輩們從未遇到的挑戰與問題,他們也在觀察、在思考。交流中,大家提得最多的就是如何在繁忙的事務中抽出時間學習來提升自己。周文教授的幾點心得使大家深受啟發:一是學習不拘泥於形式,要善於在與人的交流中學習,要跨行業吸收,設計自己的成長通道,所謂「三人行必有我師」;二是要研究規避風險與發展問題;三是要注重研究方法的創新,要集思廣益,勇於吸納更多的信息;四是邊實踐邊學習,特別是通過參觀、考察同行業的標桿企業,行萬里路有時候比讀萬卷書更重要。大家還圍繞公司輕資產的意義、小額貸款公司的贏利模式、傳統行業的新材料研究、利用隱性合同維護企業權益等企業經營中碰到的實際問題進行了廣泛的交流與研討。
創二代是新生代非公經濟代表人士的一項培育工程,也是江干區工商聯推進區域經濟轉型升級的一個重要抓手。為提高江干區青年企業家的社會責任感和創業創新能力,充分發揮青年創業人才的集聚效應,推進青年企業家二次創業並帶動更多的青年創業,在區工商業聯合會、總商會的大力支持和悉心指導下,今年5月,杭州市江干區青年企業家聯合會成立,集結了近60位青年企業家代表參加。短短三個月,他們通過組團到清華大學參加「品質杭商高級研修班」、杭商大講堂、與建德青年企業家交流幫扶貧困家庭等活動,開闊眼界、碰撞思想、勇擔責任、感恩社會,賦予了新生代創業文化更豐富的時代特徵!